Un consensus s’est développé parmi les experts scientifiques selon lequel, étant donné la composition génétique de ces bactéries, le genre Lactobacillus actuel était trop diversifié et ne se conformait pas aux conventions de nomenclature. De plus, il était important de diviser le genre en groupes fonctionnellement pertinents qui partageaient certaines propriétés physiologiques, métaboliques et certains modes de vie afin de faciliter les études fonctionnelles et écologiques sur les bactéries de ce genre.
Pour résoudre ce problème, 15 scientifiques de 12 institutions différentes et 7 pays se sont réunis, appliquant une analyse du génome entier pour analyser chaque espèce de Lactobacillus. Les scientifiques ont proposé une nouvelle classification du genre Lactobacillus, en les séparant sous les groupes des L. delbrueckii et sous les Paralactobacillus, et en ajoutant 23 nouveaux genres (Zheng et al., 2020), basée sur plusieurs approches et marqueurs génétiques (identité nucléotidique moyenne, identité moyenne d’acides aminés, identité d’acides aminés du gène noyau, phylogénie du génome central, gènes de signature et critères métaboliques ou écologiques).
Voici quelques exemples des changements :
Nom actuel
|
Nouveau nom
|
| Lactobacillus casei |
Lacticaseibacillus casei |
| Lactobacillus paracasei |
Lacticaseibacillus paracasei |
| Lactobacillus rhamnosus |
Lacticaseibacillus rhamnosus |
| Lactobacillus plantarum |
Lactiplantibacillus plantarum |
| Lactobacillus brevis |
Levilactobacillus brevis |
| Lactobacillus salivarius |
Ligilactobacillus salivarius |
| Lactobacillus fermentum |
Limosilactobacillus fermentum |
| Lactobacillus reuteri |
Limosilactobacillus reuteri |
| Lactobacillus acidophilus |
Inchangé |
| Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus(aka Lactobacillus bulgaricus) |
Inchangé |
| Lactobacillus crispatus |
Inchangé |
| Lactobacillus gasseri |
Inchangé |
| Lactobacillus johnsonii |
Inchangé |
| Lactobacillus helveticus |
Inchangé |
L’université d’Alberta a créé un outil en ligne très utile afin de pouvoir rechercher les nouveaux noms de genres à partir des anciens.
Pour en savoir plus, vous pouvez consulter l’article de recherche (Zheng et al., 2020) présentant la nouvelle taxonomie des Lactobacillus.
Orchidali peut vous aider à réaliser un état de l’art sur les effets santé des probiotiques.
English
Changement de taxonomie du genre Lactobacillus
Un consensus s’est développé parmi les experts scientifiques selon lequel, étant donné la composition génétique de ces bactéries, le genre Lactobacillus actuel était trop diversifié et ne se conformait pas aux conventions de nomenclature. De plus, il était important de diviser le genre en groupes fonctionnellement pertinents qui partageaient certaines propriétés physiologiques, métaboliques et certains modes de vie afin de faciliter les études fonctionnelles et écologiques sur les bactéries de ce genre.
Pour résoudre ce problème, 15 scientifiques de 12 institutions différentes et 7 pays se sont réunis, appliquant une analyse du génome entier pour analyser chaque espèce de Lactobacillus. Les scientifiques ont proposé une nouvelle classification du genre Lactobacillus, en les séparant sous les groupes des L. delbrueckii et sous les Paralactobacillus, et en ajoutant 23 nouveaux genres (Zheng et al., 2020), basée sur plusieurs approches et marqueurs génétiques (identité nucléotidique moyenne, identité moyenne d’acides aminés, identité d’acides aminés du gène noyau, phylogénie du génome central, gènes de signature et critères métaboliques ou écologiques).
Voici quelques exemples des changements :
L’université d’Alberta a créé un outil en ligne très utile afin de pouvoir rechercher les nouveaux noms de genres à partir des anciens.
Pour en savoir plus, vous pouvez consulter l’article de recherche (Zheng et al., 2020) présentant la nouvelle taxonomie des Lactobacillus.
Orchidali peut vous aider à réaliser un état de l’art sur les effets santé des probiotiques.
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